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传统意义上的疑难病和现代医学上的难治病存在很大的相似性，均为症状稀奇古怪，诊断不清，治疗不能奏效，涉及人体各个系统。
疑难病的产生是一个极其复杂因素综合的结果，与患者先天禀赋、后天调养、心理状况、生活环境等都有十分密切的关系。针灸在治疗疑难病方面有一个重要的特点就是辨证与辨病的统一，针灸通过对人体经络的疏通来调整内在病机，通过调节人体阴阳偏盛偏衰，从而达到“阴平阳秘”的状态，恢复其正常的生理功能。针灸通过扶正祛邪、疏通经络，利用不同的穴位，针灸手法操作，对腧穴起到兴奋和抑制的作用，双向调节不同的脏器功能，尤其在一些神经损害中被广泛应用。不仅适用于一些疑难病的急性发作期，还涉及恢复期和后遗症期。
针灸在神经系统疾病方面有突出优势，针灸对于大脑皮质功能的调节影响显著，对于受损伤脊髓功能的恢复更是起到良好的作用。有研究表明，通过电针可以激发失神经支配的肌纤维主动收缩，保持肌细胞固有的舒缩性，促进细胞内新陈代谢，减缓肌蛋白因失神经支配的功能恢复。针灸对于疑难病中急危重症有神效，往往是救急症于顷刻，通过一两个穴位的针刺或放血就能迅速控制症状，缓解病情。
